Аналіз послідовностей ДНК та РНК у браузері

Онлайн-інструмент для комплексного аналізу нуклеотидних послідовностей. Вставте ДНК або РНК — і отримайте зворотний комплемент, трансляцію білка в 6 рамках, відкриті рамки зчитування з альтернативними стартовими кодонами, карту сайтів рестрикції, аналіз якості праймерів і статистику кодонового вживання. Усі обчислення виконуються у браузері.

Як аналізувати послідовність ДНК

1
Введіть послідовність

Вставте ДНК або РНК, перетягніть FASTA-файл у поле або завантажте через кнопку FASTA. Підтримуються послідовності до 1 000 000 нт.

2
Перегляньте результати

Перемикайте вкладки: зворотний комплемент, трансляція, ORF, сайти рестрикції, перевірка праймера, кодонове вживання. Кожна вкладка оновлюється миттєво.

3
Експортуйте результати

Скопіюйте будь-який блок до буфера обміну, завантажте послідовність у форматі FASTA або карту рестрикції у форматі CSV.

🔥 Зараз у тренді
🗣️ Текст у мовлення ✨ Покращення відео ✂️ Обрізати аудіо ✨ Підсилювач аудіо 🎭 Зміна голосу 🎙️ Видалення вокалу 🎬 Відео з аудіо 🎬 Обрізання відео

Трансляція в 6 рамках, пошук ORF, карта рестрикції та перевірка праймерів

Не знаєте, що спробувати?
700+ інструментів — відкрийте сюрприз
🎲 Здивуйте мене

Особливості

Трансляція в 6 рамках і пошук ORF
Трансляція в усіх 6 рамках зчитування з трьома генетичними кодами (стандартний, мітохондріальний хребетних, бактеріальний). Виявлення ORF підтримує альтернативні старти (ATG, GTG, TTG) та налаштовувану мінімальну довжину.
650+ рестрикційних ферментів
Карта сайтів розрізання на основі великої бази REBASE — від поширених ферментів (EcoRI, BamHI, HindIII, NotI, XhoI) до рідкісних ізошизомерів. Фільтрація за поширеними, ферментами з одним розрізанням або без розрізань. Підтримуються коди IUPAC.
Перевірка якості праймера
Tm методом найближчого сусіда (SantaLucia 1998), вміст GC, молекулярна маса, виявлення шпильок і само-димерів, стабільність 3'-кінця та попередження про повтори.
Статистика послідовності
Довжина, вміст GC, нуклеотидний склад і кодонове вживання з вхідної рамки. Підтримується імпорт простого тексту та FASTA, експорт у FASTA та CSV.

Часті запитання

Які формати послідовностей підтримуються?

Звичайний текст ДНК/РНК, FASTA із заголовками >, а також багаторядкові послідовності. Коди неоднозначності IUPAC (R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N) розпізнаються. Пробіли, цифри та заголовки видаляються автоматично.

Які рестрикційні ферменти включено?

Понад 650 рестрикційних ферментів типу II із сайтами впізнавання та позиціями розрізань. За замовчуванням відображаються ~80 найпоширеніших (EcoRI, BamHI, HindIII, NotI, XhoI, SalI та інші); переключіться на «Усі ферменти» для повної бази REBASE з рідкісними ізошизомерами.

Як розраховується Tm праймера?

Методом термодинаміки найближчого сусіда з параметрами SantaLucia (1998). Умови: 50 нМ олігонуклеотид, 50 мМ Na+, 0 мМ Mg2+. Точність — у межах ±1°C для типових праймерів 18–30 нт.

Чому Tm у заголовку відрізняється від Tm праймера?

У заголовку використовується правило Воллеса (2°C·AT + 4°C·GC) для коротких (<14 нт) і формула на основі GC% для 14–50 нт; для довших послідовностей Tm не відображається. Вкладка «Праймер» використовує точніший метод найближчого сусіда.

Як виконується пошук ORF?

Перевіряються всі 6 рамок (3 прямі + 3 зворотного комплементу). ORF охоплює ділянку від стартового кодона (ATG; мітохондріальний також ATA/ATT/GTG; бактеріальний також GTG/TTG) до наступного стоп-кодона. Мінімальна довжина налаштовується.

Як працює аналіз?

Аналіз послідовності виконується у вашому браузері за допомогою JavaScript — інструмент розбирає FASTA-введення, транслює кодони та будує карту сайтів рестрикції в реальному часі.

💡 Хочете, щоб ми покращили цей інструмент спеціально для вас?

Звичайно! Просто надішліть нам коротке повідомлення з вашою ідеєю. Якщо хочете обговорити детальніше — залиште email, і ми зв’яжемося з вами. Можна залишитися анонімом.

Може сподобатися

🔬 Spectrogram Lab 🧬 Аналізатор гелю 🔬 Лічильник клітин

Як ви оцінюєте цей інструмент?

Дякуємо за вашу оцінку!
Хочете розповісти більше? Залиште коментар!
Дякуємо! Ваш коментар з’явиться після модерації.
Опубліковано Оновлено Автор: